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siRNA transfection

试剂

  • siRNA(公司一般会提供3种siRNA,1个通用阴性对照,1个FAM标记通用阴性对照,1个GAPDH阳性对照)
  • 转染试剂为Lipo2000或Lipo3000
  • Opti-MEM,或者简单化为无抗生素无血清培养基(特殊的,若转染BMDM的话,需补充20ng/mL的M-CSF)

环境

  • siRNA长期放置最好以冻干粉形式保存,可保存1年以上。第一次溶解时先勿开盖,在1000g,4°C离心1min后,用DEPC水溶解至20pmol/μL(推荐值),分装保存,避免反复冻融,-20°C至-80°C可保存半年以上。
  • siRNA最好冰上放置,整个实验过程,要求RNA酶free,枪头、EP管等都应该经过无酶处理。

转染前准备

  • 至少3个平行重复
  • 推荐转染使用的细胞密度为70%-80%
  • 建议转染前12h更换细胞培养基为Opti-MEM

转染步骤

以下步骤以24孔板为例,所有用量和体积均按每孔给出。对于其他规格,请参见{# https://github.com/gohugoio/hugo/blob/master/tpl/tplimpl/embedded/templates/_markup/render-link.html #}“扩大或缩小转染规模”

  1. 稀释siRNA:在无菌管中加入50μL的Opti-MEM,再加入20pmol的siRNA低聚体,用移液枪轻轻混匀,室温静置5min。
  2. 稀释转染试剂:在另一无菌管中加入50μL的Opti-MEM,再加入1μL的Lipo2000,用移液枪轻轻混匀,室温静置5min。
  3. 将已稀释的Lipo2000加入到已稀释的siRNA低聚体中,用移液枪轻轻混匀,室温静置15min。(不能静置超过30min,最好15min后立即加入孔板)
  4. 将siRNA低聚体-Lipo2000复合物添加至孔板中,轻轻晃动细胞板至均匀分布。
  5. 根据后续实验需求在培养箱中孵育细胞24-96小时。24-48h检测mRNA表达(qRT-PCR),48-96h检测蛋白表达(Western Blot)。
  6. 可在6-8h更换为完全培养基,避免细胞长时间饥饿造成的细胞活力损失。

扩大或缩小转染规模

Culture vessel Surf. area per well1 Vol. of plating medium Vol. of dilution medium2 RNA Lipofectamine 2000
96-well 0.3 cm 2 100 µl 2 x 25 µl 5 pmol 0.25 µl
24-well 2 cm 2 500 µl 2 x 50 µl 20 pmol 1.0 µl
12-well 4 cm 2 1 ml 2 x 100 µl 40 pmol 2.0 µl
6-well 10 cm 2 2 ml 2 x 250 µl 100 pmol 5 µl
60-mm 20 cm 2 5 ml 2 x 0.5 ml 200 pmol 10 µl
10-cm 60 cm 2 15 ml 2 x 1.5 ml 600 pmol 30 µl

1 Surface areas may vary depending on the manufacturer.
2 Volumes of dilution medium in Step 2a & 2b of DNA or RNAi transfection protocols.

Reference

  1. {# https://github.com/gohugoio/hugo/blob/master/tpl/tplimpl/embedded/templates/_markup/render-link.html #}Lipofectamine 2000
  2. {# https://github.com/gohugoio/hugo/blob/master/tpl/tplimpl/embedded/templates/_markup/render-link.html #}Guidelines for RNA Transfection
  3. {# https://github.com/gohugoio/hugo/blob/master/tpl/tplimpl/embedded/templates/_markup/render-link.html #}Optimizing siRNA Transfection
  4. {# https://github.com/gohugoio/hugo/blob/master/tpl/tplimpl/embedded/templates/_markup/render-link.html #}Selecting an RNAi Strategy